tôi đang làm việc trên cửa sổ. Tôi nghĩ rằng tôi đã cài đặt biopython với pip trong một môi trường conda cụ thể. Nguyên nhân với
conda activate models
pip install biopython
nói
Requirement already satisfied: biopython in c:\users\tania\.conda\envs\models\lib\site-packages [1.74]
Requirement already satisfied: numpy in c:\users\tania\appdata\roaming\python\python35\site-packages [from biopython] [1.16.3]
Tuy nhiên khi chạy trong pycharm
import biopython
Đưa ra lỗi
ImportError: No module named 'biopython'
Tôi chắc chắn rằng nó đã được cài đặt đúng env vì tôi đã cài đặt các mô-đun python khác ở đó và chúng đã hoạt động. Đã thử thêm biến vào đường dẫn người dùng như được giải thích tại đây. https. //www. opentechguides. com/how-to/article/windows-10/113/windows-10-set-path. html nhưng nó vẫn không hoạt động
Trăn sinh học • 2. 3k lượt xemTHÊM NHẬN XÉT • liên kết 3. 3 năm trước bởi kỳ nhông ▴ 510
0
Vào chế độ chỉnh sửa
3. 3 năm trước
ram 37k
Tôi không nghĩ đó là
import biopython
0, mà là import biopython
1THÊM NHẬN XÉT • liên kết 3. 3 năm trước bởi Ram 37k
0
Vào chế độ chỉnh sửa
cũng không hoạt động với Bio. Ngay cả sau khi thêm vào đường dẫn của các biến hệ thống.
import biopython
2 Có thiếu thứ gì không?THÊM TRẢ LỜI • liên kết 3. 3 năm trước bởi kỳ nhông ▴ 510
0
Vào chế độ chỉnh sửa
Bạn có thể thực hiện các thí nghiệm sau và xem mọi thứ bị hỏng ở đâu không
- Mở python trong conda env
3, sau đó chạyimport biopython
1 để xem nó có hoạt động khôngimport biopython
- Nếu 1 hoạt động, hãy thử chạy python bên ngoài conda env, rồi
1import biopython
- Nếu 2 hoạt động, thì hãy thử
1 từ bên trong PyCharmimport biopython
Các bước trên sẽ cho bạn biết liệu đó có phải là trăn không thể nhìn thấy vị trí mô-đun hay PyCharm đang hành động hài hước. Bước 1 xác nhận rằng bạn có cài đặt biopython đang hoạt động. Ngoài ra, từ mỗi cái, in ra
Requirement already satisfied: biopython in c:\users\tania\.conda\envs\models\lib\site-packages [1.74]
Requirement already satisfied: numpy in c:\users\tania\appdata\roaming\python\python35\site-packages [from biopython] [1.16.3]
2 để xem thư mục bạn đã thêm có hiển thị trong biến Requirement already satisfied: biopython in c:\users\tania\.conda\envs\models\lib\site-packages [1.74]
Requirement already satisfied: numpy in c:\users\tania\appdata\roaming\python\python35\site-packages [from biopython] [1.16.3]
3 không Cài đặt
import biopython
7 từ kênh import biopython
8 có thể đạt được bằng cách thêm import biopython
8 vào các kênh của bạn vớiconda config --add channels conda-forge
conda config --set channel_priority strict
Khi kênh
import biopython
8 đã được bật, có thể cài đặt import biopython
7 với conda install biopython
1conda install biopython
hoặc với
conda install biopython
2Requirement already satisfied: biopython in c:\users\tania\.conda\envs\models\lib\site-packages [1.74]
Requirement already satisfied: numpy in c:\users\tania\appdata\roaming\python\python35\site-packages [from biopython] [1.16.3]
0Có thể liệt kê tất cả các phiên bản của
import biopython
7 có sẵn trên nền tảng của bạn với conda install biopython
1Requirement already satisfied: biopython in c:\users\tania\.conda\envs\models\lib\site-packages [1.74]
Requirement already satisfied: numpy in c:\users\tania\appdata\roaming\python\python35\site-packages [from biopython] [1.16.3]
2hoặc với
conda install biopython
2Requirement already satisfied: biopython in c:\users\tania\.conda\envs\models\lib\site-packages [1.74]
Requirement already satisfied: numpy in c:\users\tania\appdata\roaming\python\python35\site-packages [from biopython] [1.16.3]
4Ngoài ra,
conda install biopython
6 có thể cung cấp thêm thông tinRequirement already satisfied: biopython in c:\users\tania\.conda\envs\models\lib\site-packages [1.74]
Requirement already satisfied: numpy in c:\users\tania\appdata\roaming\python\python35\site-packages [from biopython] [1.16.3]
6Giới thiệu về conda-forgeconda-forge là kênh conda do cộng đồng lãnh đạo gồm các gói có thể cài đặt. Để cung cấp các bản dựng chất lượng cao, quá trình này đã được tự động hóa trong tổ chức GitHub của conda-forge. Tổ chức conda-forge chứa một kho lưu trữ cho mỗi gói có thể cài đặt. Một kho lưu trữ như vậy được gọi là một nguồn nguyên liệu
Nguyên liệu được tạo thành từ công thức conda [hướng dẫn về nội dung và cách xây dựng gói] và các cấu hình cần thiết để xây dựng tự động bằng cách sử dụng các dịch vụ tích hợp liên tục có sẵn miễn phí. Nhờ dịch vụ tuyệt vời được cung cấp bởi Azure, GitHub, CircleCI, AppVeyor, Drone và TravisCI, có thể xây dựng và tải các gói có thể cài đặt lên kênh Anaconda-Cloud conda-forge cho Linux, Windows và OSX tương ứng
Để quản lý việc tích hợp liên tục và đơn giản hóa việc bảo trì nguyên liệu conda-smithy đã được phát triển. Sử dụng
conda install biopython
7 trong kho lưu trữ này, có thể hiển thị lại tất cả các tệp hỗ trợ của nguyên liệu này [và. g. các tệp cấu hình CI] với conda install biopython
8Để biết thêm thông tin, vui lòng kiểm tra tài liệu conda-forge
thuật ngữnguyên liệu - công thức conda [nguyên liệu thô], tập lệnh hỗ trợ và cấu hình CI
conda-smithy - công cụ giúp sắp xếp nguyên liệu. Công dụng chính của nó là xây dựng các tệp CI
conda install biopython
9 và đơn giản hóa việc quản lý nhiều nguyên liệuconda-forge - nơi nguyên liệu và lò rèn sinh sống và làm việc để sản xuất thành phẩm [bản phân phối conda được xây dựng]
Cập nhật biopython-feedstockNếu bạn muốn cải thiện công thức biopython hoặc xây dựng phiên bản gói mới, vui lòng rẽ nhánh kho lưu trữ này và gửi PR. Sau khi gửi, các thay đổi của bạn sẽ được chạy trên các nền tảng phù hợp để người đánh giá có cơ hội xác nhận rằng những thay đổi đó dẫn đến một bản dựng thành công. Sau khi hợp nhất, công thức sẽ được xây dựng lại và tự động tải lên kênh
import biopython
8, sau đó các gói conda đã xây dựng sẽ có sẵn để mọi người cài đặt và sử dụng từ kênh import biopython
8. Lưu ý rằng tất cả các nhánh trong conda-forge/biopython-feedstock đều được xây dựng ngay lập tức và mọi gói đã tạo đều được tải lên, do đó, PR nên dựa trên các nhánh trong nhánh và chỉ nên sử dụng các nhánh trong kho lưu trữ chính để xây dựng các phiên bản gói riêng biệt