Hướng dẫn write mat file python - ghi tệp mat bằng python

Tôi quản lý để chuyển đổi một hình ảnh, sử dụng một vòng lặp để chuyển đổi tất cả.

Nội phân chính

  • Tại sao chúng ta sử dụng các tệp .mat trong Python?
  • 1. Cài đặt Scipy
  • 2. Nhập mô -đun scipy.io.loadmat
  • 3. Phân tích cấu trúc tệp .mat
  • 4. Sử dụng khung dữ liệu gấu trúc để làm việc với dữ liệu
  • Làm cách nào để chuyển đổi tệp MAT thành hình ảnh?
  • Làm cách nào để đọc hình ảnh .mat trong Python?
  • Làm thế nào để bạn xử lý một tệp .mat trong python?
  • Làm thế nào để bạn chuyển đổi .mat thành .jpg trong matlab?

Vui lòng đọc các ý kiến.

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import h5py
from PIL import Image

#reading v 7.3 mat file in python
#https://stackoverflow.com/questions/17316880/reading-v-7-3-mat-file-in-python

filepath = '1.mat';
f = h5py.File(filepath, 'r') #Open mat file for reading

#In MATLAB the data is arranged as follows:
#cjdata is a MATLAB struct
#cjdata.image is a matrix of type int16

#Before update: read only image data.   
####################################################################
#Read cjdata struct, get image member and convert numpy ndarray of type float
#image = np.array(f['cjdata'].get('image')).astype(np.float64) #In MATLAB: image = cjdata.image
#f.close()
####################################################################

#Update: Read all elements of cjdata struct
####################################################################
#Read cjdata struct
cjdata = f['cjdata'] #

# In MATLAB cjdata = 
# struct with fields:
#   label: 1
#   PID: '100360'
#   image: [512×512 int16]
#   tumorBorder: [38×1 double]
#   tumorMask: [512×512 logical]

#get image member and convert numpy ndarray of type float
image = np.array(cjdata.get('image')).astype(np.float64) #In MATLAB: image = cjdata.image

label = cjdata.get('label')[0,0] #Use [0,0] indexing in order to convert lable to scalar

PID = cjdata.get('PID') # 
PID = ''.join(chr(c) for c in PID) #Convert to string https://stackoverflow.com/questions/12036304/loading-hdf5-matlab-strings-into-python

tumorBorder = np.array(cjdata.get('tumorBorder'))[0] #Use [0] indexing - convert from 2D array to 1D array.

tumorMask = np.array(cjdata.get('tumorMask'))

f.close()
####################################################################

#Convert image to uint8 (before saving as jpeg - jpeg doesn't support int16 format).
#Use simple linear conversion: subtract minimum, and divide by range.
#Note: the conversion is not optimal - you should find a better way.
#Multiply by 255 to set values in uint8 range [0, 255], and covert to type uint8.
hi = np.max(image)
lo = np.min(image)
image = (((image - lo)/(hi-lo))*255).astype(np.uint8)

#Save as jpeg
#https://stackoverflow.com/questions/902761/saving-a-numpy-array-as-an-image
im = Image.fromarray(image)
im.save("1.jpg")

#Display image for testing
imgplot = plt.imshow(image)
plt.show()

Lưu ý: Mỗi tệp mat chứa một cấu trúc có tên cjdata. Các trường của CJDATA Struct:
Each mat file contains a struct named cjdata.
Fields of cjdata struct:

cjdata = 

struct with fields:

      label: 1
        PID: '100360'
      image: [512×512 int16]
tumorBorder: [38×1 double]
  tumorMask: [512×512 logical]

Khi chuyển đổi hình ảnh thành

cjdata = 

struct with fields:

      label: 1
        PID: '100360'
      image: [512×512 int16]
tumorBorder: [38×1 double]
  tumorMask: [512×512 logical]
0, bạn đang mất thông tin ...

Một số lượng lớn các bộ dữ liệu cho khoa học và nghiên cứu dữ liệu, sử dụng các tệp .mat. Trong bài viết này, chúng tôi sẽ học cách làm việc với các tệp .mat trong Python và khám phá chúng một cách chi tiết. .mat files. In this article, we’ll learn to work with .mat files in Python and explore them in detail.

Tại sao chúng ta sử dụng các tệp .mat trong Python?

1. Cài đặt Scipy.mat file may not seem obvious right off the bat. But when working with large datasets, the information contained within these files is absolutely crucial for data science/machine learning projects!

2. Nhập mô -đun scipy.io.loadmat.mat files contain the metadata of every object/record in the dataset.

3. Phân tích cấu trúc tệp .mat.mat files.

4. Sử dụng khung dữ liệu gấu trúc để làm việc với dữ liệu

Làm cách nào để chuyển đổi tệp MAT thành hình ảnh?

Làm cách nào để đọc hình ảnh .mat trong Python?

1. Cài đặt Scipy

2. Nhập mô -đun scipy.io.loadmat

3. Phân tích cấu trúc tệp .mat

4. Sử dụng khung dữ liệu gấu trúc để làm việc với dữ liệu

2. Nhập mô -đun scipy.io.loadmat

3. Phân tích cấu trúc tệp .mat

from scipy.io import loadmat
annots = loadmat('annotation_0001.mat')
print(annots)

4. Sử dụng khung dữ liệu gấu trúc để làm việc với dữ liệu

{'__header__': b'MATLAB 5.0 MAT-file, Platform: PCWIN, Created on: Tue Dec 14 15:57:03 2004', '__version__': '1.0', '__globals__': [], 'box_coord': array([[  2, 300,   1, 260]], dtype=uint16), 'obj_contour': array([[ 37.16574586,  61.94475138,  89.47697974, 126.92081031,
        169.32044199, 226.03683241, 259.07550645, 258.52486188,
        203.46040516, 177.5801105 , 147.84530387, 117.0092081 ,
          1.37384899,   1.37384899,   7.98158379,   0.82320442,
         16.2412523 ,  31.65930018,  38.81767956,  38.81767956],
       [ 58.59300184,  44.27624309,  23.90239411,   0.77532228,
          2.97790055,  61.34622468, 126.87292818, 214.97605893,
        267.83793738, 270.59116022, 298.67403315, 298.67403315,
        187.99447514,  94.93554328,  90.53038674,  77.31491713,
         62.44751381,  62.99815838,  56.94106814,  56.94106814]])}

Làm cách nào để chuyển đổi tệp MAT thành hình ảnh?.mat file provides information regarding the version of MATLAB used, the platform, the date of its creation, and a lot more.

Làm cách nào để đọc hình ảnh .mat trong Python?

3. Phân tích cấu trúc tệp .mat

4. Sử dụng khung dữ liệu gấu trúc để làm việc với dữ liệu

Làm cách nào để chuyển đổi tệp MAT thành hình ảnh?

Làm cách nào để đọc hình ảnh .mat trong Python?

con_list = [[element for element in upperElement] for upperElement in annots['obj_contour']]

Làm thế nào để bạn xử lý một tệp .mat trong python?

[[37.16574585635357, 61.94475138121544, 89.47697974217309, 126.92081031307546, 169.32044198895025, 226.03683241252295, 259.0755064456721, 258.52486187845295, 203.4604051565377, 177.58011049723754, 147.84530386740326, 117.0092081031307, 1.3738489871086301, 1.3738489871086301, 7.98158379373848, 0.8232044198894926, 16.24125230202577, 31.65930018416205, 38.81767955801104, 38.81767955801104], [58.59300184162066, 44.27624309392269, 23.90239410681403, 0.7753222836096256, 2.9779005524862328, 61.34622467771641, 126.87292817679563, 214.97605893186008, 267.83793738489874, 270.59116022099454, 298.6740331491713, 298.6740331491713, 187.9944751381216, 94.93554327808477, 90.53038674033152, 77.31491712707185, 62.44751381215474, 62.998158379373876, 56.94106813996319, 56.94106813996319]]

4. Sử dụng khung dữ liệu gấu trúc để làm việc với dữ liệu

Làm cách nào để chuyển đổi tệp MAT thành hình ảnh?

Làm cách nào để đọc hình ảnh .mat trong Python?

Làm thế nào để bạn xử lý một tệp .mat trong python?Pandas.

Làm thế nào để bạn chuyển đổi .mat thành .jpg trong matlab?

Vui lòng đọc các ý kiến.

Lưu ý: Mỗi tệp mat chứa một cấu trúc có tên cjdata. Các trường của CJDATA Struct:

# zip provides us with both the x and y in a tuple.
newData = list(zip(con_list[0], con_list[1]))
columns = ['obj_contour_x', 'obj_contour_y']
df = pd.DataFrame(newData, columns=columns)

Khi chuyển đổi hình ảnh thành

cjdata = 

struct with fields:

      label: 1
        PID: '100360'
      image: [512×512 int16]
tumorBorder: [38×1 double]
  tumorMask: [512×512 logical]
0, bạn đang mất thông tin ...

    obj_contour_x  obj_contour_y
0       37.165746      58.593002
1       61.944751      44.276243
2       89.476980      23.902394
3      126.920810       0.775322
4      169.320442       2.977901
5      226.036832      61.346225
6      259.075506     126.872928
7      258.524862     214.976059
8      203.460405     267.837937
9      177.580110     270.591160
10     147.845304     298.674033
11     117.009208     298.674033
12       1.373849     187.994475
13       1.373849      94.935543
14       7.981584      90.530387
15       0.823204      77.314917
16      16.241252      62.447514
17      31.659300      62.998158
18      38.817680      56.941068
19      38.817680      56.941068

Một số lượng lớn các bộ dữ liệu cho khoa học và nghiên cứu dữ liệu, sử dụng các tệp .mat. Trong bài viết này, chúng tôi sẽ học cách làm việc với các tệp .mat trong Python và khám phá chúng một cách chi tiết.

Mục đích của một tệp .mat có vẻ không rõ ràng ngay lập tức. Nhưng khi làm việc với các bộ dữ liệu lớn, thông tin có trong các tệp này là hoàn toàn quan trọng đối với các dự án khoa học/máy học dữ liệu!

Điều này là do các tệp .mat chứa siêu dữ liệu của mọi đối tượng/bản ghi trong tập dữ liệu..mat file is different but, with experience and practice, creating them out of .mat files should come naturally to you.

Mặc dù các tệp không được thiết kế chính xác cho mục đích duy nhất là tạo các chú thích, rất nhiều nhà nghiên cứu sử dụng MATLAB cho nghiên cứu và thu thập dữ liệu của họ, gây ra nhiều chú thích mà chúng tôi sử dụng trong việc học máy để có mặt dưới dạng tệp .mat .

Sự kết luận

Bây giờ bạn đã biết cách làm việc với các tệp .mat trong Python và cách tạo các khung dữ liệu trong gấu trúc với nội dung của nó..mat files in Python, and how to create dataframes in pandas with its content.

Các bước tiếp theo để làm việc với dữ liệu này sẽ là và tạo các mô hình của riêng bạn hoặc sử dụng các mô hình hiện có để đào tạo hoặc kiểm tra bản sao của bạn.

Người giới thiệu

  1. Tài liệu chính thức của Scipy.io
  2. Tài liệu chính thức của Gandas DataFrame

Làm cách nào để chuyển đổi tệp MAT thành hình ảnh?

Chuyển đổi Mat thành JPG..

Tải xuống và cài đặt phiên bản Filestar mới nhất ..

Nhấp chuột phải vào một hoặc nhiều tệp MAT trên máy tính để bàn của bạn và chọn Chuyển đổi bằng FileStar ..

Nhập chuyển đổi sang JPG trong hộp tìm kiếm ..

Nhấn Chuyển đổi ..

Làm cách nào để đọc hình ảnh .mat trong Python?

Theo mặc định, Python không có khả năng đọc. Tệp mat. Chúng ta cần nhập một thư viện biết cách xử lý định dạng tệp ...

Cài đặt Scipy. Tương tự như cách chúng tôi sử dụng mô -đun CSV để làm việc. ....

Nhập Scipy. io. ....

Phân tích phân tích. ....

Sử dụng các khung dữ liệu gấu trúc để làm việc với dữ liệu ..

Làm thế nào để bạn xử lý một tệp .mat trong python?

Các tập tin MAT trong Python ?..

Lần đầu tiên đọc tài liệu ..

Sử dụng Trình chỉnh sửa Hex (chẳng hạn như HXD) và xem xét tham chiếu. mat -file bạn muốn phân tích ..

Cố gắng tìm ra ý nghĩa của từng byte bằng cách lưu byte vào a. ....

Sử dụng các lớp để lưu từng phần tử dữ liệu (như micompressed, mimatrix, mxdouble hoặc miint32).

Làm thế nào để bạn chuyển đổi .mat thành .jpg trong matlab?

Liên kết trực tiếp đến câu trả lời này..

% Tải biến hình ảnh từ tệp MAT vào cấu trúc s ..

s = load (yourFilename) ;.

% Trích xuất hình ảnh từ cấu trúc ..

rgbimage = s. ....

% Viết vào đĩa ở định dạng JPG, mà bạn không bao giờ nên sử dụng để phân tích hình ảnh ..

Imwrite (rgbimage, 'ifage của tôi.jpg') ;.